Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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