Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms