Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms