Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms