Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms