Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DCHS1Q96JQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms