Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms