Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC97Q96F63 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms