Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM12Q96EX1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms