Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLUAP1Q96AJ1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLUAP1Q96AJ1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms