Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms