Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms