Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms