Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms