Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms