Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms