Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL3Q8N8U3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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