Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX29P2Q8IUI4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms