Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLNKQ7Z7G1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms