Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms