Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms