Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms