Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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