Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms