Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRSAM1Q6UWE0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms