Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms