Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms