Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms