Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP350Q5VT06 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms