Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms