Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms