Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms