Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms