Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms