Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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