Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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