Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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