Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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