Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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