Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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IFT88Q13099 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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IFT88Q13099 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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IFT88Q13099 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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IFT88Q13099 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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IFT88Q13099 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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