Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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