Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms