Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAP2Q03519 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TAP2Q03519 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms