Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms