Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMF1P82094 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMF1P82094 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMF1P82094 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms