Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO4P61968 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMO4P61968 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms