Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2NP61088 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms