Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP107P57740 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms