Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP6P55212 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP6P55212 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms