Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPAP53621 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPAP53621 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPAP53621 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPAP53621 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms